常见问题
发布时间：2023-11-22 作者：[信息网络中心]程印乾 阅读：569次
1、我想用学校的高性能计算平台做计算，从哪里开始？
请访问高性能计算平台：https://hpc.cugb.edu.cn。
简单来讲分为如下几个步骤：1）申请账号；2）登录平台；3）准备数据；4）提交作业
2、为什么从docker hub拉镜像会失败？
答：目前平台暂不支持ubuntu22.04版本，支持的版本如下：CentOS: 6,7,8 Ubuntu: 14.04,16.04,18.04,20.04
3、队列有空闲节点，但任务在排队？
答：高性能计算校级公共平台采用slurm作业调度系统，整个队列中可能有需要占用多节点的高优先级任务正在等待资源，
调度器会一定程度上为这些作业保留资源，以确保它们能够运行。可以命令行执行squeue查看排队情况，当NODELIST(REASON)列显示状态为resource或者priority时，
代表正常排队中，有资源释放排队任务会自动运行。
4、文件不小心误删了怎么办？
答：由于集群采用共享存储，文件删除无法找回，请谨慎执行rm命令。
5、我可以指定计算节点进行作业提交么？
答：可以，#SBATCH --nodelist 是 Slurm 工作负载管理器的一个选项，它允许你指定一个或多个计算节点来运行你的
作业。你可以在你的 Slurm 脚本中使用这个选项，或者在 sbatch、salloc命令行中使用它。例如，如果你想在名为
"comput2" 和 "comput6" 的节点上运行你的作业，你可以在你的 Slurm 脚本中添加以下行：
#SBATCH --nodelist=comput2,comput6
或者，你可以在 sbatch 命令行中使用 --nodelist 选项：
sbatch --nodelist=comput2,comput6 myscript.sh
或者，如果你想在名为 "comput2" 和 "comput6" 的节点上启动一个交互式会话，你可以使用
以下命令：
salloc --nodelist=comput2,comput6
请注意，你只能指定你有权限使用的节点，而且这些节点必须是可用的。如果你指定的节点不可用，或者你没有权限使用它
们，你的作业可能无法启动。
6、我能通过命令行查询我排队作业的预计开始时间么？
答：在使用 Slurm 工作负载管理器的系统中，你可以使用 squeue 命令来查看队列中的作业，但是默认情况下，它并不会显示作业的预计开始时间。然而，你可以使用 squeue 的 -o 或 --format 选项来自定义输出，并包含预计开始时间。
例如，你可以使用以下命令来显示每个作业的作业 ID、用户名和预计开始时间：
squeue -o "%i %u %S"
在这个命令中，`%i`、`%u` 和 `%S` 是格式说明符，分别代表作业 ID、用户名和预计开始时间。
然而，需要注意的是，这个预计开始时间是一个估计值，实际的开始时间可能会因为各种因素（如其他作业的运行时间、系统的负载等）而有所不同。
7、我需要安装软件，能帮我安装一下吗？
答：对于开源软件如果需要root权限，请下载安装程序后放在home目录下联系管理员安装。对于商业软件，请将安装程序及正版授权放在home目录下联系管理员安装。对于可以通过conda安装的软件请自行安装。
8、我的计算程序在台式机和笔记本上运行很慢，在超算集群上运行是不是就会加快？
答：简单的结论是不一定，需要具体问题具体分析。串行程序加速效果不会明显，并行程序如果可以多核并行，性能可能会有所提升。
9、我原来都是在windows上操作软件，不会用Linux，我现在想学习一些基本的Linux操作，满足超算上机需要，应该学哪些内容？
答：首先了解一下Linux的目录结构，Linux的目录以树形组织。
其次学习几个常用的Linux命令，主要是：
pwd –查看当前所在目录
cd –改变目录
cp –复制文件
rm -删除文件
mv –文件重命名
mkdir –创建目录
10、用户的个人数据及其它可以长期保留在平台上吗？
答：不可以。高算平台为校级公共资源，高算中心将定期清理长期占用资源的“僵尸”数据，同时，为了避免不必要的网络或系统风险，请各位用户务必及时备份重要个人数据，以免给您造成损失。
11、充值充多少合适？
答：需要用户根据收费标准和使用习惯自行进行预估;
例如申请32个核心，用满24小时价格最低为32 * 0.08 * 24=61.44元；
一块GPU卡，用满24小时价格最低为1 * 3.6 * 24=86.4元。
12、如果校内转账，从项目的哪个科目报销？
答：建议“其他委托业务费”
13、在发表论文中，如何注明高性能计算平台支持？
答：目前，高性能计算校级平台对支持发表的论文制定了机时费奖励政策，用户在发表论文时，需要注明 “本研究工作得到中国地质大学（北京）高性能计算平台支持” （This work was supported by the High-performance Computing Platform of China University of Geosciences Beijing.），并通过本平台提交成果报告，审核通过后，获得相应机时奖励。
